杭州高级职称论文查重的过程可以按照以下步骤进行：

一、了解查重系统和要求
杭州高级职称论文的查重系统主要采用知网CNKI，这个系统的要求相对严格，对于字数的最小起跳单位为一千字，也就是说，一千字以下的文字内容是不会被检测出来进行比对的。因此，在撰写论文时，需要注意分段和分章节，避免大段文字的引用和复制。

二、选择合适的比对库
知网CNKI的高级职称论文查重系统主要采用学术论文比对库和硕博论文比对库，因此，在选择比对库时，需要选择学术论文和硕博论文作为比对范围。

三、注意论文结构
论文的结构应该清晰明了，分段和分章节要合理。一般来说，可以按照提出问题、分析问题、解决问题的逻辑顺序来组织论文，尽量避免大段文字的引用和复制。

四、合理使用引号和注释
在撰写论文时，需要合理使用引号和注释，尤其是对于引用的文献和数据，一定要使用引号标明出处。同时，也可以采用交叉引用和脚注的方式，避免文字重复。

五、注意论文格式
论文格式也是查重的一个重要因素，需要注意字体、字号、行间距等细节，尽量避免格式错误或者不规范导致的查重误判。

六、测试查重系统
在提交论文之前，可以测试一下查重系统，了解自己的论文与比对库中的文献相似度有多少，哪些部分被检测出来相似，从而进行相应的修改。

七、注意论文查重率
论文查重率是查重结果的一个重要指标，但是不同的查重系统的查重率也不同，因此，需要选择正规渠道和平台进行查重检测，同时也要注意不要过分依赖查重率，而是应该注重论文的质量和创新性。

总之，杭州高级职称论文的查重需要按照相关规定和要求进行，需要注意论文的结构、格式、引用和注释等细节。同时也要注意选择合适的查重系统和平台进行检测，以保证论文的质量和创新性。